氟苯尼考作为氯霉素的替代药物，无潜在致再生障碍性贫血的隐患，安全性较好，且价格较低，应用广泛。但由于其在家禽体内代谢慢，在鸡蛋、鸡肉中残留的时间较长，如果未严格遵照休药期而匆忙上市，对人体健康是有风险的。根据2002年农业部第235号公告，氟苯尼考为农业部批准使用的动物专用抗菌药，但产蛋家禽禁止使用氟苯尼考。
9月，山东省畜牧局通报2017年上半年畜产品质量安全监督抽检的信息，四家畜牧单位因使用沙丁胺醇（俗称瘦肉精）、氟苯尼考等食品禁用添加剂而被通报。
8月，青海省、海南省、上海市、佛山市、西安市等5地皆有鸡蛋被检出违禁兽药恩诺沙星、环丙沙星和氟苯尼考。
根据中华人民共和国农业部令（2017年第8号）和兽药停药期规定（2003年5月22日农业部公告第278号），氟苯尼考的休药期规定如下：
氟苯尼考粉 部颁标准 猪20日，鸡5日，鱼375度日
氟苯尼考溶液 部颁标准 鸡5日，产蛋期禁用
食药监总局关于鸡蛋中违禁兽药氟苯尼考的风险解读
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