2019年2月27日 ，巴西学者Giuliana Loreto Saraiva 等人在Viruses发表了Retrospective Detection and Genetic Characterization of Porcine circovirus 3 (PCV3) Strains Identified between 2006 and 2007 in Brazil。
本文关注的是一种新兴病毒——猪圆环病毒3 (PCV3)。
听说又有新兴病毒，猪猪表示压力很大！
PCV3是2016年在美国首次发现的一种新兴病毒。自首次发现以来，PCV3已在美洲、亚洲和欧洲等世界多地区发现。
猪圆环病毒（PCV）是无包膜和单链环状DNA病毒。
PCV1最早在1974年发现的，不表现临床疾病有关。
PCV2最早在20世纪90年代发现，症状称为猪圆环病毒相关疾病（PCVAD），研究表明其会导致猪场显著经济损失。
PCV3是2016年在美国首次发现的一种新兴病毒，表现猪皮炎肾病综合征（PDNS）的临床症状。
PCV3首次被发现后，世界上很多国家的学者进行了回顾性流行病学研究以了解PCV3的流行病学和分子进化。
中国学者分析了1990年至1999年间收集的猪的临床样本，其中6.5％为PCV3阳性，第一例发生在1996年。
英国一项回顾性研究的结果显示，在2001年至2004年间收集的5％的组织样本中检测到PCV3。
在瑞典，1993年至2007年间收集的样本中有20.4％是阳性。
西班牙一项流行病学研究结果证实，自1996年以来，PCV3一直在西班牙猪群中流行。
2 PCV3在巴西的主要猪肉产区流行吗？
3 巴西毒株的序列容易变异吗？
4 在巴西，PCV3的存在对猪群有多大影响？
他们对以前收集的巴西猪样品进行了回顾性检测，做了PCV3的流行病学研究和分子进化分析。
本次研究的样品为2006年至2007年期间从巴西9个州收集的67例猪临床样本。
图1 2006年至2007年间从巴西9个州采集的67份猪组织样本的分布情况。斜杠前的数字代表PCV3阳性样品数，斜杠后的数字代表每个州的样品总数。字母缩写代表巴西州名字。
上面提到的问题有了答案。
Q:
PCV3是否已于2016年前在巴西已流行？
A:
是的！2006年至2007年期间，巴西9个州收集的67份临床样本通过PCR筛查了PCV3，47.8％的样本（32/67）被发现为阳性。
Q:
PCV3在巴西的主要猪肉产区流行吗？
A:
是的！来自巴西主要养猪区的所有九个州的样品中都发现存在PCV3。
Q:
巴西毒株的序列容易变异吗？
A:
不容易变异。
样品中PCV3的Cap蛋白序列的多态性分析表明，存在多个多态位点（表1）。但是，中性试验表明，强有力的纯化选择作用于Cap蛋白。因此，PCV3的Cap蛋白似乎受到强烈限制，并且不能耐受其序列的高水平变异，也就是说不容易产生变异。
此外，分子进化分析表明，2006年和2007年收集的PCV3序列与2016年获得的巴西毒株具有高度同一性（图2）。这些结果表明PCV3巴西毒株在过去10年中可能表现出遗传稳定性。
表1 2006年和2007年以及2016年采集的巴西猪圆环病毒3 (PCV3) Cap蛋白序列的多态性分析。每一列对应的氨基酸残基的位置是可变的。“-” :代表无变化 “†”:代表与PCV2共感染
Q:
在巴西，PCV3的存在对猪群有多大影响？
A:
先看其共感染和单一感染情况。PCV2的总阳性样本率为40.3％（27/67）。在32个PCV3阳性样品中，37.5％（12/32）是PCV2阳性。样品中PCV3的单一感染率为29.8％（20/67）。
有趣的是，仅在PCV2阳性样品或共感染样品中出现临床症状。PCV3的单一感染样品猪没有表现临床症状。
此外，健康猪的PCV3阳性率为29.8％（20/67），而在不健康的猪中，阳性PCV3率为17.9％，健康猪的PCV3阳性率高于不健康猪，说明在分析的样本中，大多数猪在PCV3感染下没有任何临床症状，并能活得好好的。
但是，不可以掉以轻心。最近有实验表明pcv3感染可引起严重的仔猪猪皮炎肾病综合征（PDNS） ，并可致仔猪死亡。（在另一个研究的发现）
图2 PCV3的ORF2序列的分子进化树
ORF2序列的系统发育树显示至少有两个簇可以被定义(分别命名为PCV3a和PCV3b)(图2)，包括巴西毒株和在美洲、亚洲和欧洲收集的其他毒株，说明PCV3分布在世界各地，没有任何地域限制。
在分子进化树中，巴西PCV3毒株聚集在PCV3a和PCV3b基因型簇中， 并且两种巴西毒株与从野猪获得的毒株同源性较高，表明野猪可能作为PCV3感染载体发挥重要的流行病学作用。
本文由汪孟航、周盼伊翻译整理
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