生长育肥猪的腹泻问题在商品猪场很常见，对全球养猪业影响很大。一些感染源会引起4周龄以上猪的肠道紊乱，像轮状病毒、圆环病毒、大肠杆菌、短螺旋体、沙门氏菌、耶尔森氏菌、胞内劳森氏菌、有齿管口线虫、鞭虫等等。实际上，受病原、饲料、水和环境因素影响，大多数猪都会在断奶后出现腹泻和结肠炎。
PCV2是引发PCV2系统病（PCV2-SD）和PCV2亚临床感染（PCV2-SI）的基本病原，也被认为是系统病原。目前，PCV2被认为是引发猪腹泻的病原，有人提出：PCV2肠道疾病（PCV2-ED）是PCV里独立的一部分。它的诊断标准包括：a）猪腹泻；b）肉芽肿性肠炎，显微镜下可见小肠淋巴组织（不包括其它淋巴组织）中淋巴细胞损伤；c）肠粘膜或小肠淋巴结检测的PCV2含量从中到高，未检测其它淋巴结。
为了阐明PCV2肠道疾病的实际发生率，本文研究了西班牙生长育肥猪感染PCV2的患病率，评估PCV2肠道疾病和 PCV2系统病之间的重叠性。本研究选取96头腹泻猪，尸检后样品送到西班牙巴塞罗那自治大学兽医学院诊断实验室检测。本研究（表1）实验期为1998-2011年，仅涉及未接种PCV2疫苗的猪。最常见的肠道病变是粘膜炎（77.1％），纤维素性（11.5％）和肉芽肿性（4.2％）肠炎/结肠炎；除此之外，还有肠道出血或溃疡（4.2％）。原位杂交（ISH）检测发现72头猪（75％）为PCV2阳性。在PCV2阳性猪中，确诊39头猪被PCV2-SD感染，33头猪无明显的淋巴样病变但在一些淋巴组织的核酸病毒含量很低。结果，33头猪是PCV2系统病，但不符合PCV2肠道疾病。实际上，一些淋巴结PCV2含量低的病理学解释有3种可能： a）PCV2-SI，b）PCV2系统病初始阶段，c）PCV2系统病恢复阶段。
下表描绘了感染PCV2猪的筛选和诊断标准。
总之，本研究的结果表明，可以忽略PCV2肠道疾病，PCV2主要对与PCV2系统病相关的肠道紊乱起作用。
需要强调的是：在被PCV2系统病感染的猪场，肠道问题频繁发生。然而，猪被感染并出现腹泻的确切机制尚不清楚。一方面，与PCV2系统病相关的系统免疫抑制是主要因素，它会引发猪场已存在的肠道病原体，但除非危及免疫系统，否则它不会表达。此外，PCV2系统病病理结果涉及不同程度的肉芽肿性肠炎（图1和2），它可以通过改变肠壁渗透性，引起腹泻。在本实验中，PCV2疫苗引起猪死亡，猪场只表现出PCV2系统病的临床症状，因此，与病毒感染相伴发生的其他肠道病原也显著下降。
图1. 回肠。感染PCV2系统病的猪的肠道淋巴结明显的淋巴细胞损伤和肉芽肿性炎症。
图2. 回肠感染PCV2系统疾病的同一段回肠肠道淋巴结和肠粘膜的PCV2基因组量很多。原位杂交检测PCV2。
疫苗免疫引起常见的PCV2临床症状（最常见的PCV2-SI形式），而病毒对系统和/或消化病变影响很小。因此，当出现腹泻问题时，也会发生PCV2-SI，可能存在共同感染肠道病原体，但随后其中的一种病原成为主要病原。因此，为了确定肠道疾病每种病原的比例，使用有效的诊断工具很重要。病原检测（总数和组织病理学）能有效评估这种病。
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