据中国兽药协会统计，2013年全国1661家兽药生产企业完成生产总产值437.46亿元，销售额401.83亿元，毛利润120.27亿元，平均毛利率29.93%。近六年来，产业整体规模逐步扩大，销售额逐年增长，2013年趋于平缓，产值年复合增长率14.55%，销售额年复合增长率为13.64%。在兽药行业整体取得业绩增长和规模扩大的同时，另一方面也暴露出了行业的诸多问题和不足。
在第五届兽药大会主题论坛上，中国兽医药品监察所所长冯忠武介绍，我国的兽药企业总体上以中型为主，生药企业以大中型企业为中坚力量，化药企业以中小型企业为主。72家生药企业中，大型企业18家，占总数的25%；中型企业46家，占63.89%；小型企业8家，占11.11%。1589家化药企业中，大型企业27家，占总数的1.7%；中型企业817家，占51.41%；小型企业602家，占37.89%；微型企业143家，占9%。我国新药研发主要以仿制为主，且集中在食品动物。其中，抗感染药研发占主导地位，但兽药剂型和制剂种类单一，中兽药和中西复方制剂品种繁多。
产品结构不合理是我国兽药企业的典型特征。据冯忠武介绍，按产品剂型分，目前我国粉散剂和预混剂产量最多。一些高科技兽药剂型，如靶向剂型、透皮吸收剂等却十分稀少；如10%阿莫西林可溶性粉有1029家企业取得批准文号；5%阿莫西林可溶性粉有376家企业取得批号；扶正解毒散有967家企业取得；清瘟败毒散有898家企业取得批号。
按使用动物分，主要为常规的家畜家禽用兽药，而大家畜、特种动物、观赏动物、宠物等动物用的品种非常缺乏，特别是宠物用药，主要为人用药品。生物制品中，水禽疫苗、水生动物疫苗和诊断试剂比较缺乏；从工艺角度分析，耐热保护剂疫苗、稳定可靠的多价苗、多联苗以及佐剂等尚有待进一步开发。
“重复建设比较严重，产能过剩问题仍然比较突出。”冯忠武表示，在生物制品行业，2013年活疫苗生产能力产能利用率30.96%；灭活疫苗产能利用率36.4%。原料药行业抗微生物药产能利用率最高，为53.08%（见右图）；化药制剂和中药方面，颗粒剂产能利用率最低，仅10.88%；消毒药（固体）产能利用率最高，也仅为33.26%。
新兽药研发问题突出，新兽药研制开发主体错位。冯忠武称，国外制药发达国家新药（兽药）研发的主体是企业，大学、研究院所主要着重基础研究。而在我国，新兽药研究主要由专业院校和国家的研究院所来承担，新药研发的主体是国家。同时，我国绝大多数兽药企业规模不大，难以承担新兽药研究的高投入、高风险，尚不能成为兽药技术创新的主体，造成新兽药研制与市场需求脱节。
据冯忠武介绍，我国从事新兽药研究与开发的人员不足1万人。国内企业研发人员比例绝大多数少于3%，企业缺乏自主创新的领袖人物。但国际大企业研发人员比例一般都在10%以上。
冯忠武提出，今后我国兽药研发的重点是安全、高效、环保兽药。须从环保、维护社会公共卫生安全的高度出发，开展安全、高效新型杀虫剂、抗菌制剂的研究。重点发展原料药，尤其是发展动物专用的原料药。兽用原料药的研究开发，仍以抗菌药物和抗寄生虫药物为主导方向，同时注重发展兽药新剂型。冯忠武称，还需加强宠物和水生动物用药的开发，大力开发中草药制剂。
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