大肠杆菌广泛地存在自然界中，在人类公共卫生中是重点防御的一类病原，而在畜牧业生产环境中的大肠杆菌却往往被忽视。鸡舍内及其周围环境中的大肠杆菌极易污染饲料、饮水和器具，带菌鸡通过呼吸道和粪便排出病菌形成鸡舍内大肠杆菌强大的污染源。某规模化种鸡场曾进行过实验，在进行严格消毒后在饮水中和地面上没分离到细菌的情况下，在空气中却分离到大量不同血清型的大肠杆菌，其中致病性占94%，强致病性占40%。由此可以看出鸡舍及其周围环境中长期存在大量致病性大肠杆菌，使鸡群时刻处于被大肠杆菌感染威胁的情况之下，从而导致大肠杆菌病反复发生感染。目前我国已分离到的致病性大肠杆菌的血清型达50个，而且不同地区有不同的血清型，就是在同一地区不同养殖场也有不同的血清型，甚至在同一鸡场同一鸡群可以存在多个血清型。不同血清型之间的抗原交叉保护性较弱，只有用导致发病的血清型制备的抗原才能产生较好的保护力，而由于该病众多的血清型，不可能制备一种覆盖所有血清型的超广谱疫苗，因此大肠杆菌病的疫苗普遍存在保护率较低的问题。我国的鸡群在整个饲养管理期，需用大量的广谱抗菌素防治球虫病和沙门氏菌、禽霍乱等细菌性疾病的发生，同时又在饲料中添加抗生素促进生长，无意中培育了大量的大肠杆菌耐药菌株。因此，造成目前我国鸡大肠杆菌耐药性问题极为严重，过去临床上敏感药物的疗效已大大下降，而且出现多重耐药菌株，甚至同时耐9种抗菌药物的情况。目前大肠杆菌产生耐药性的速度极快，在山东地区对盐酸环丙沙星进行连续三年的耐药性调查发现，1996年盐酸环丙沙星治疗大肠杆菌的有效率为100%，1997年为63.7%，而1998年降低到33.3%，在短短的三年内，盐酸环丙沙星在该地区就处于被淘汰的境地。药物使用周期的缩短必然促使新药开发的力度加大，旧药的淘汰速度加快，从而导致药物成本增加，养殖用户投入防治大肠杆菌病的费用也相应增加，养殖效益逐渐下降。目前国内的具体情况而言，引起鸡对大肠杆菌最敏感最常见的因素主要是病毒性感染，尤其是新城疫、禽流感、传染性支气管炎和传染性喉气管炎。病毒中的一些强毒株可迅速引起鸡只死亡，往往来不及引起大肠杆菌感染，而那些非高致病力毒株临床症状不明显，不易被发现，但其会破坏呼吸道和消化道粘膜屏障系统的完整性，从而为大肠杆菌病的入侵开辟了门户。另外一些免疫抑制性疾病如法氏囊病可使鸡的免疫系统出现损伤，产生抗体的能力下降，因而对大肠杆菌的抵抗力也下降。目前人们为了增强疫苗的免疫效果，选用的毒株越来越强，病毒在机体呼吸道和消化道粘膜中复制时也必将损伤细胞，虽然这种损伤较轻微，也加剧了大肠杆菌病的感染机会，这是目前许多鸡场在接种疫苗后易暴发大肠杆菌病的一个重要原因。
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