近年来越来越多的发现人畜共患疾病不仅威胁畜牧业发展，更是对人类的健康产生直接的威胁，例如非典病毒、禽流感病毒。又如在猪、牛、羊中传播极快的口蹄疫病毒,也是对人类健康潜在威胁。利用RNA干扰技术，可以一旦在家畜中疾病暴发后，先采用干扰技术抑制病毒快速传播，减少大牲畜的屠宰数量，降低经济损失，为随后大规模免疫接种争取时间，提高免疫效率。还有些动物可能是人类病毒天然栖息载体，病毒在这些受感染动物体内呈现隐性感染状态，并不发病。例如鸭、鹅是禽流感的病毒库，猪是由禽流感转变为能人传人病毒的主要中间宿主。又如牛，常会隐性携带口蹄疫病毒，而要彻底清除这些中间宿主体内病毒，RNA干扰技术会起巨大作用。
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